在法院还是在婚姻登记机关办理离婚手续，两者的法律效力有本质区别。通过人民法院办理协议离婚，会把夫妻财产明确到司法文书上，称为民事调解书，具有强制执行力。
例如，离婚文书上写到，男方在两年内，支付女方人民币10万，分两次还清。在男方拒绝支付的情况下，女方有权拿这个文书，申请人民法院强制执行。法院会向男方追偿应该履行的义务，不需要女方亲自去追偿。
婚姻登记机关的离婚协议是公民之间的民事协议。签离婚协议书，是基于对对方非常信赖，靠对方信誉来履行的。如果男方不履行义务，女方只能向人民法院再次提起诉讼，耗时耗力。
通过人民法院协议离婚的手续非常简便，时间不超过半天，手续费用也很少。
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